犀角(Diceros Horn) 2005 10 01

ImageJ を使って 3D 表示する(2)

さて、sourceforge の ImageJ Plugiins に行ってみる。そこの IJ Plugins: 3D Toolkit の手順にしたがってインストールする。 具体的には、

• ij-3D-Toolkit の最新バージョンのバイナリ版 zip を落としてくる。
• zip ファイルを展開して、3D IO、3D Toolkit、VTK Filters のフォルダを ImageJ の plugin の中にコピーする。
• ij-plugins-toolkit.jar をクラスパスに通す。
• vtk.orgからVTKの最新バージョンをダウンロードして、インストールする。
• vtk.jar をクラスパスに通す。
• ImageJ を実行。

VTK ファイルの表示はメニューの Plugins から。File からではないので注意。 マウスでグリグリ視点を変える方法はよくわからない。ImageJ じゃ無理？

VTK を直接 Java で扱えばできるのだろう。次にやって見よう。

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ImageJ を使って 3D 表示する(1)

ImageJ というアメリカ国立衛生研究所(NIH)が作っているソフトウェアがある。 Java ベースの画像解析用のソフトウェアで、plugin やマクロで機能を追加できる。 おそらくMRIなどの医療用の画像を表示したり、画像処理したりするのが 目的で開発されたのだろう。これの 3D 表示用の plugin を使ってみる ことを目標にする。

まずは ImageJ 単体の起動。上に書いた ImageJ のサイトから最新版を ダウンロード。JDK1.5 の環境では、JRE のバンドル版じゃなくて JAR File バージョンで大丈夫だった。zip ファイルを展開して ij.jar と言うファイルができたら、そこで

$ java -jar ij.jar

とすればよい。これで jpeg や gif ファイルを開いて簡単なフィルタを かけたりすることができる。Java で書かれているが、それほど遅くはない。

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